Células executáveis
Combine explicação, parâmetros e chamadas de aplicações. Células comuns permanecem no navegador; chamadas network.submit tornam-se jobs.
Ambiente científico autenticado
Da célula ao resultado, em uma única rota.
O LABIO Workspace reúne notebook, ferramentas de bioinformática, fila de jobs, dispositivos, créditos, tutoriais e resultados. O usuário prepara a análise; o scheduler escolhe somente um nó compatível e registra toda a execução.
50FERRAMENTAS NO CATÁLOGO CIENTÍFICO
15FAMÍLIAS COM EXECUTOR CONECTADO
3TIPOS DE NÓ: MOBILE, DESKTOP E SERVER
1CONTA, SALDO E HISTÓRICO UNIFICADOS
01
O ambiente de trabalho científico.
Cada área do Workspace resolve uma etapa: preparar, executar, acompanhar, aprender e registrar.
Ferramentas científicas
Software organizado por área, finalidade, entrada aceita, perfil de recursos e estágio de integração com a rede.
Fila e acompanhamento
Status, dispositivo selecionado, progresso, consumo, falhas e resultados ficam associados à conta e à execução.
Capacidade distribuída
Celulares, computadores e servidores informam arquitetura, recursos, disponibilidade e software compatível.
Uso e contribuição
A conta mostra saldo, débitos por tarefas, créditos recebidos, horas utilizadas, horas cedidas e histórico mensal.
Resultados e métricas
Taxa de conclusão, ferramentas usadas, nós selecionados e movimentações ajudam a reproduzir e auditar o trabalho.
02
Como um job percorre a rede.
O Workspace não envia qualquer tarefa para qualquer aparelho. Cada job passa por validação, compatibilidade e registro.
Aplicação e entrada
O usuário informa ferramenta, dados, parâmetros e recursos desejados.
Validação
O cliente verifica campos obrigatórios, limites e formato do payload.
Identidade e créditos
A solicitação permanece vinculada à conta autenticada.
Requisitos
Compara arquitetura, software, threads, memória, GPU e disponibilidade.
Fila
O job aguarda até existir um nó autorizado e realmente compatível.
Reserva do nó
Somente o executor selecionado recebe a tarefa e seus dados de entrada.
Execução isolada
A ferramenta roda com limites compatíveis com o dispositivo.
Saída e diagnóstico
Arquivos, métricas e mensagens de erro retornam ao Workspace.
Histórico e créditos
Status, consumo e movimentação ficam registrados na conta.
Modos de execução
Uma célula pode explicar, calcular ou distribuir.
O notebook é a interface de preparação. O tipo da célula e a aplicação escolhida definem se o trabalho permanece local ou se vira um job distribuído.
Regra prática: código comum ajuda a organizar a análise. Uma chamada explícita para
network.submit cria um job com contrato de entrada, recursos e ferramenta identificados.Texto e protocoloDocumente hipótese, amostra, parâmetros, critérios de validação e interpretação.
Python científicoScripts controlados em executor próprio, com threads e memória declaradas.
R científicoAnálise estatística e rotinas reprodutíveis em ambiente compatível.
Aplicação empacotadafastp, BLAST+, GROMACS e outras ferramentas recebem entradas estruturadas.
03
Execução compatível com cada dispositivo.
O tipo do nó não define sozinho onde um job roda. A decisão final depende da arquitetura, do pacote instalado, dos recursos livres e da política de acesso.
LABIO Mobile
Recebe tarefas compatíveis de CPU e inferência leve quando o usuário autoriza a contribuição e o aparelho atende aos requisitos.
- Carga ajustada ao dispositivo
- Somente pacotes ARM64 disponíveis
- Estado online e limites respeitados
- Não substitui servidor em cargas grandes
LABIO Desktop
Transforma computadores pessoais e workstations em nós controlados, além de oferecer acesso rápido ao ambiente autenticado.
- CPU e memória mais amplas
- Execução local autorizada
- Integração com runtimes empacotados
- Adequado para análises intermediárias
LABIO Server
Atende workstations, laboratórios e infraestrutura institucional com imagens científicas, cotas e políticas definidas pelo responsável.
- Grandes volumes e longas execuções
- Maior disponibilidade de RAM
- GPU quando declarada pelo nó
- Controle institucional de acesso
Sobre celulares: uma tarefa só é enviada ao smartphone quando o executor correspondente está empacotado para Android ARM64, o aparelho está online e os limites de bateria, memória, temperatura e uso permitem. Caso contrário, o job permanece na fila ou segue para outro nó compatível.
Execução conectada
Famílias que já possuem contrato de job.
Estas integrações já têm payload reconhecido pelo Workspace. A disponibilidade real depende da versão do aplicativo e das imagens reportadas por cada nó.
● Executor conectadoTutorial disponívelIntegração planejada
Sequências e genômica
7 famíliasfastpBLAST+MMseqs2MAFFTSPAdesHyPhyBiopython
Estruturas e modelagem
5 famíliasOpen BabelAutoDock VinaGROMACSFreeSASARDKit · Docker
Computação científica
2 runtimesPython Scientific · DockerR Scientific · Docker
Inferência leve
1 runtimeONNX Runtime Mobile
04
Um ambiente, seis componentes especializados.
Cada camada possui uma função própria e uma página detalhada. Conheça o aplicativo, o cliente ou o serviço antes de abrir o ambiente operacional.
INTELIGÊNCIA CIENTÍFICA ↗
LABIO AI
Assistência contextual, leitura de documentos, elaboração de workflows e roteamento entre modelos.
ENTENDER A IA E O ROUTER AMBIENTE DO PESQUISADOR ↗LABIO Workspace
Notebook, aplicações, jobs, dispositivos, créditos, histórico, tutoriais e resultados em uma conta.
VOCÊ ESTÁ NESTA PÁGINA ORQUESTRAÇÃO DA REDE ↗Auto Scheduler
Compatibilidade, políticas, prioridade, fila, reserva do nó e acompanhamento da execução.
ENTENDER A DECISÃO DE ROTA INFRAESTRUTURA INSTITUCIONAL ↗LABIO Server
Servidores e workstations Linux com recursos, imagens científicas, cotas e acesso controlado.
INSTALAÇÃO E PAREAMENTO ESTAÇÃO DE TRABALHO ↗LABIO Desktop
Cliente para Windows, Linux e macOS, com acesso ao ambiente e contribuição controlada.
CONHECER AS VERSÕES DESKTOP ANDROID · ARM64 ↗LABIO Mobile
Acompanhamento da conta e participação voluntária em tarefas leves compatíveis com o aparelho.
CONHECER O APLICATIVO05
Catálogo científico completo.
As 50 ferramentas estão organizadas na ordem natural da análise. O ponto verde identifica nomes que já aparecem entre os contratos executáveis; os demais permanecem no roteiro de integração.
50 ferramentas visíveis● verde = executor conectado
01Controle de qualidade das leiturasDo FASTQ bruto ao relatório consolidado5 ferramentas
02Mapeamento, genômica e variantesReferência, BAM/CRAM, chamada e associação12 ferramentas
03Montagem e avaliação de genomasLeituras curtas, longas, qualidade e completude4 ferramentas
04Transcriptômica e RNA-seqAlinhamento, quantificação e expressão diferencial9 ferramentas
05Metagenômica e microbiomaClassificação, abundância, função e amplicons6 ferramentas
06Sequências, alinhamento e filogeniaHomologia, alinhamentos e evolução molecular8 ferramentas
07Bioinformática estruturalPreparação, docking, dinâmica e análise estrutural5 ferramentas
08Programação científicaAutomação e integração transversal1 ferramenta
Antes da análise: o módulo “Do sequenciador ao FASTQ” explica Sanger, NGS, TGS, Illumina/HiSeq/NovaSeq, PacBio e Oxford Nanopore, incluindo biblioteca, base calling, demultiplexação e formatos de saída. Ele é um módulo educacional e não entra na contagem das 50 ferramentas.
06
O que permanece registrado.
A execução distribuída precisa ser compreensível depois que termina — inclusive quando falha.
Job associado à conta
Solicitação, conversa, saldo e resultados ficam separados por usuário e pelas autorizações institucionais.
Ferramenta e parâmetros
Aplicação, versão, entradas, recursos solicitados e dispositivo selecionado compõem o histórico operacional.
Status e movimentação
Fila, execução, conclusão, falha, tempo computacional e créditos podem ser acompanhados na mesma conta.
Disponível para contas LABIO.NETWORK
Prepare a análise e deixe o scheduler encontrar o recurso certo.
Entre no Workspace para abrir o notebook, consultar ferramentas, acompanhar jobs e gerenciar seus dispositivos.