LABIO.NETWORK
LABIO.NETWORK Ecossistema Workflows
SCIENTIFIC WORKFLOWS

Comece pelo problema científico.

Os workflows apresentam a sequência lógica de uma análise. Na área pública você entende o pipeline; no Workspace serão configurados dados, parâmetros, recursos e jobs.

6 templates iniciais
5 domínios científicos
Modular etapas reutilizáveis
Workspace configuração e execução
WORKFLOW LIBRARY

Pipelines apresentados passo a passo.

Escolha a área científica e examine a sequência de etapas e ferramentas relacionadas.

BIOLOGIA ESTRUTURAL Template público

Molecular Docking

Fluxo para preparação de receptor e ligante, execução de docking e organização das poses.

ReceptorLigantePreparaçãoDockingRanking
APPLICATIONS AutoDock VinaGNINAOpen Babel
SIMULAÇÃO Template público

Molecular Dynamics

Preparação do sistema, equilíbrio, produção e análise de trajetórias moleculares.

EstruturaTopologiaSistemaEquilíbrioProduçãoAnálises
APPLICATIONS GROMACS
GENÔMICA Template público

Whole-Genome Analysis

Pipeline geral para dados de sequenciamento, controle de qualidade, montagem e análise.

FASTQQCAssemblyAnnotationResults
APPLICATIONS fastpSPAdes
METAGENÔMICA Template público

Metagenomics

Processamento de dados metagenômicos para análise taxonômica e funcional.

ReadsQCHost removalAssemblyTaxonomy
APPLICATIONS fastpSPAdes
EVOLUÇÃO Template público

Phylogenetics

Fluxo para alinhamento, reconstrução filogenética e análises evolutivas.

SequencesMSAModelTreeEvolution
APPLICATIONS MAFFTHyPhy
BIOLOGIA ESTRUTURAL Template público

Structural Analysis

Análises de exposição, contatos e comparação de estruturas.

StructureSASAContactsCompareReport
APPLICATIONS FreeSASABiopython
WORKFLOW NO WORKSPACE

O template é o início, não a execução.

A versão pública explica o fluxo. A execução real depende do projeto, dos dados selecionados e dos recursos computacionais disponíveis.

Projeto Define o contexto da análise.
Dados Entradas do Workspace, upload ou recursos científicos selecionados.
Parâmetros Configuração apropriada ao método e à aplicação selecionada.
Compute Recursos compatíveis com os requisitos daquele job.
Resultados Outputs, registros de execução e informações de proveniência.
LABIO WORKSPACE

A área pública mostra o caminho. O Workspace realiza o trabalho.

O login continua levando diretamente ao ambiente de trabalho da LABIO.NETWORK. Não existe uma segunda plataforma intermediária entre o Ecossistema e o Workspace.