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LABIO DATA HUB

Descubra dados para sua pesquisa.

Um catálogo público para organizar e facilitar a descoberta de fontes utilizadas em bioinformática, biologia molecular, genômica e modelagem computacional.

12 fontes no catálogo inicial
6 categorias científicas
Público exploração sem autenticação
Workspace camada operacional autenticada
CATÁLOGO

Bancos de dados e recursos científicos.

Pesquise pelo nome, área ou conteúdo principal do recurso.

GENÔMICA Fonte externa

NCBI

Coleções públicas de sequências, genomas, dados de sequenciamento e expressão.

Fornecedor NCBI
Uso Genomas · Sequências · SRA · GEO
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PROTEÍNAS Fonte externa

UniProt

Informações de sequência, função e anotação de proteínas.

Fornecedor UniProt Consortium
Uso Proteínas · Função · Anotação
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ESTRUTURAS Fonte externa

RCSB Protein Data Bank

Estruturas tridimensionais experimentais de macromoléculas biológicas.

Fornecedor wwPDB / RCSB
Uso PDB · Estruturas · Complexos
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ESTRUTURAS Fonte externa

AlphaFold DB

Modelos estruturais preditos de proteínas disponibilizados para consulta.

Fornecedor EMBL-EBI / DeepMind
Uso Modelos estruturais
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SEQUENCIAMENTO Fonte externa

ENA

Arquivo europeu para sequências de nucleotídeos e dados de sequenciamento.

Fornecedor EMBL-EBI
Uso Reads · Assemblies · Sequências
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GENÔMICA Fonte externa

Ensembl

Recursos para genomas, genes, variantes e anotação comparativa.

Fornecedor EMBL-EBI
Uso Genes · Genomas · Variantes
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METAGENÔMICA Fonte externa

MGnify

Recursos públicos para microbiomas, metagenomas e dados associados.

Fornecedor EMBL-EBI
Uso Microbioma · Metagenômica
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VARIANTES Fonte externa

ClinVar

Arquivo público de variantes e relações com fenótipos e interpretação clínica.

Fornecedor NCBI
Uso Variantes · Evidências
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VARIANTES Fonte externa

dbSNP

Catálogo público de variantes de nucleotídeo e pequenas variações.

Fornecedor NCBI
Uso SNPs · Variantes
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QUÍMICA Fonte externa

PubChem

Compostos químicos, estruturas, propriedades e dados de bioatividade.

Fornecedor NCBI
Uso Compostos · Estruturas · Bioatividade
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QUÍMICA Fonte externa

ChEMBL

Informações de moléculas bioativas e dados farmacológicos associados.

Fornecedor EMBL-EBI
Uso Ligantes · Bioatividade
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PROTEÍNAS Fonte externa

InterPro

Classificação de proteínas em famílias, domínios e sítios funcionais.

Fornecedor EMBL-EBI
Uso Domínios · Famílias · Função
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DATA HUB + WORKSPACE

Da descoberta ao projeto.

A página pública funciona como catálogo. A integração operacional com projetos será realizada dentro do Workspace.

01 · Descobrir Identifique a fonte científica adequada ao problema.
02 · Selecionar Localize sequências, estruturas, datasets ou compostos de interesse.
03 · Workspace No ambiente autenticado, os dados poderão ser associados a projetos e workflows.
04 · Processar Jobs científicos utilizam aplicações e recursos computacionais disponíveis para aquela análise.